Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TSSK2Q96PF2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSSK2Q96PF2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TSSK2Q96PF2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TSSK2Q96PF2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSSK2Q96PF2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSSK2Q96PF2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSSK2Q96PF2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSSK2Q96PF2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSSK2Q96PF2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSSK2Q96PF2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSSK2Q96PF2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSSK2Q96PF2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSSK2Q96PF2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSSK2Q96PF2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSSK2Q96PF2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSSK2Q96PF2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSSK2Q96PF2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSSK2Q96PF2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSSK2Q96PF2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSSK2Q96PF2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSSK2Q96PF2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSSK2Q96PF2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSSK2Q96PF2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSSK2Q96PF2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSSK2Q96PF2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TSSK2Q96PF2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSSK2Q96PF2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TSSK2Q96PF2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSSK2Q96PF2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSSK2Q96PF2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSSK2Q96PF2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSSK2Q96PF2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSSK2Q96PF2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSSK2Q96PF2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSSK2Q96PF2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSSK2Q96PF2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSSK2Q96PF2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSSK2Q96PF2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSSK2Q96PF2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSSK2Q96PF2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSSK2Q96PF2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSSK2Q96PF2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSSK2Q96PF2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSSK2Q96PF2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSSK2Q96PF2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSSK2Q96PF2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSSK2Q96PF2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK2Q96PF2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK2Q96PF2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSSK2Q96PF2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSSK2Q96PF2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSSK2Q96PF2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSSK2Q96PF2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSSK2Q96PF2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSSK2Q96PF2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSSK2Q96PF2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSSK2Q96PF2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSSK2Q96PF2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSSK2Q96PF2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSSK2Q96PF2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSSK2Q96PF2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSSK2Q96PF2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSSK2Q96PF2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSSK2Q96PF2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSSK2Q96PF2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSSK2Q96PF2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSSK2Q96PF2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSSK2Q96PF2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSSK2Q96PF2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSSK2Q96PF2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSSK2Q96PF2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSSK2Q96PF2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSSK2Q96PF2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSSK2Q96PF2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSSK2Q96PF2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSSK2Q96PF2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSSK2Q96PF2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSSK2Q96PF2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSSK2Q96PF2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSSK2Q96PF2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSSK2Q96PF2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSSK2Q96PF2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSSK2Q96PF2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSSK2Q96PF2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSSK2Q96PF2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TSSK2Q96PF2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSSK2Q96PF2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSSK2Q96PF2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSSK2Q96PF2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSSK2Q96PF2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSSK2Q96PF2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSSK2Q96PF2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSSK2Q96PF2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSSK2Q96PF2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSSK2Q96PF2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSSK2Q96PF2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSSK2Q96PF2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSSK2Q96PF2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSSK2Q96PF2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms