Protein–RNA interactions for Protein: Q96PC3

AP1S3, AP-1 complex subunit sigma-3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S3Q96PC3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP1S3Q96PC3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP1S3Q96PC3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP1S3Q96PC3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP1S3Q96PC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1S3Q96PC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S3Q96PC3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S3Q96PC3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S3Q96PC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S3Q96PC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP1S3Q96PC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP1S3Q96PC3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S3Q96PC3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP1S3Q96PC3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP1S3Q96PC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP1S3Q96PC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP1S3Q96PC3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S3Q96PC3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP1S3Q96PC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP1S3Q96PC3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1S3Q96PC3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP1S3Q96PC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S3Q96PC3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S3Q96PC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S3Q96PC3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S3Q96PC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S3Q96PC3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S3Q96PC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S3Q96PC3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S3Q96PC3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S3Q96PC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S3Q96PC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S3Q96PC3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S3Q96PC3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S3Q96PC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S3Q96PC3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S3Q96PC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S3Q96PC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S3Q96PC3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S3Q96PC3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S3Q96PC3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP1S3Q96PC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP1S3Q96PC3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S3Q96PC3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP1S3Q96PC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP1S3Q96PC3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP1S3Q96PC3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S3Q96PC3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP1S3Q96PC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S3Q96PC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S3Q96PC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S3Q96PC3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S3Q96PC3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S3Q96PC3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S3Q96PC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S3Q96PC3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S3Q96PC3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S3Q96PC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1S3Q96PC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S3Q96PC3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S3Q96PC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP1S3Q96PC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S3Q96PC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP1S3Q96PC3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP1S3Q96PC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S3Q96PC3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP1S3Q96PC3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S3Q96PC3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP1S3Q96PC3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S3Q96PC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S3Q96PC3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S3Q96PC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S3Q96PC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S3Q96PC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S3Q96PC3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S3Q96PC3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S3Q96PC3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S3Q96PC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S3Q96PC3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S3Q96PC3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S3Q96PC3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S3Q96PC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S3Q96PC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP1S3Q96PC3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP1S3Q96PC3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S3Q96PC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP1S3Q96PC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP1S3Q96PC3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP1S3Q96PC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP1S3Q96PC3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP1S3Q96PC3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP1S3Q96PC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP1S3Q96PC3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP1S3Q96PC3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP1S3Q96PC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP1S3Q96PC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP1S3Q96PC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S3Q96PC3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP1S3Q96PC3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S3Q96PC3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms