Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVZ7

RNF133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF133Q8WVZ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF133Q8WVZ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF133Q8WVZ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF133Q8WVZ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF133Q8WVZ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF133Q8WVZ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF133Q8WVZ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF133Q8WVZ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF133Q8WVZ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF133Q8WVZ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF133Q8WVZ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF133Q8WVZ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF133Q8WVZ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF133Q8WVZ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF133Q8WVZ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF133Q8WVZ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF133Q8WVZ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF133Q8WVZ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF133Q8WVZ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF133Q8WVZ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF133Q8WVZ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF133Q8WVZ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF133Q8WVZ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF133Q8WVZ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF133Q8WVZ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF133Q8WVZ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF133Q8WVZ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF133Q8WVZ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF133Q8WVZ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF133Q8WVZ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF133Q8WVZ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF133Q8WVZ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF133Q8WVZ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF133Q8WVZ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF133Q8WVZ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF133Q8WVZ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF133Q8WVZ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF133Q8WVZ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF133Q8WVZ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF133Q8WVZ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF133Q8WVZ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF133Q8WVZ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF133Q8WVZ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF133Q8WVZ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF133Q8WVZ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF133Q8WVZ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF133Q8WVZ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF133Q8WVZ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF133Q8WVZ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF133Q8WVZ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF133Q8WVZ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF133Q8WVZ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF133Q8WVZ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF133Q8WVZ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF133Q8WVZ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF133Q8WVZ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF133Q8WVZ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF133Q8WVZ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF133Q8WVZ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF133Q8WVZ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF133Q8WVZ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF133Q8WVZ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF133Q8WVZ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF133Q8WVZ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF133Q8WVZ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF133Q8WVZ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF133Q8WVZ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF133Q8WVZ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF133Q8WVZ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF133Q8WVZ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF133Q8WVZ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF133Q8WVZ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF133Q8WVZ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF133Q8WVZ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF133Q8WVZ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF133Q8WVZ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF133Q8WVZ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF133Q8WVZ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF133Q8WVZ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF133Q8WVZ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF133Q8WVZ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF133Q8WVZ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF133Q8WVZ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF133Q8WVZ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF133Q8WVZ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF133Q8WVZ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF133Q8WVZ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF133Q8WVZ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF133Q8WVZ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF133Q8WVZ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF133Q8WVZ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF133Q8WVZ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF133Q8WVZ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF133Q8WVZ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF133Q8WVZ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF133Q8WVZ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF133Q8WVZ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF133Q8WVZ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF133Q8WVZ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF133Q8WVZ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms