Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NECAB1Q8N987 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NECAB1Q8N987 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
NECAB1Q8N987 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NECAB1Q8N987 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NECAB1Q8N987 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NECAB1Q8N987 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NECAB1Q8N987 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NECAB1Q8N987 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NECAB1Q8N987 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NECAB1Q8N987 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NECAB1Q8N987 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NECAB1Q8N987 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NECAB1Q8N987 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NECAB1Q8N987 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NECAB1Q8N987 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NECAB1Q8N987 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NECAB1Q8N987 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NECAB1Q8N987 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NECAB1Q8N987 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NECAB1Q8N987 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NECAB1Q8N987 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NECAB1Q8N987 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NECAB1Q8N987 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NECAB1Q8N987 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NECAB1Q8N987 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NECAB1Q8N987 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NECAB1Q8N987 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NECAB1Q8N987 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NECAB1Q8N987 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NECAB1Q8N987 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NECAB1Q8N987 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NECAB1Q8N987 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NECAB1Q8N987 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NECAB1Q8N987 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NECAB1Q8N987 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NECAB1Q8N987 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NECAB1Q8N987 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NECAB1Q8N987 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NECAB1Q8N987 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NECAB1Q8N987 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NECAB1Q8N987 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NECAB1Q8N987 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NECAB1Q8N987 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NECAB1Q8N987 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NECAB1Q8N987 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NECAB1Q8N987 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NECAB1Q8N987 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NECAB1Q8N987 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NECAB1Q8N987 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NECAB1Q8N987 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NECAB1Q8N987 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NECAB1Q8N987 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NECAB1Q8N987 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NECAB1Q8N987 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NECAB1Q8N987 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NECAB1Q8N987 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NECAB1Q8N987 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NECAB1Q8N987 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NECAB1Q8N987 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NECAB1Q8N987 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NECAB1Q8N987 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NECAB1Q8N987 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NECAB1Q8N987 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NECAB1Q8N987 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NECAB1Q8N987 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NECAB1Q8N987 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NECAB1Q8N987 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NECAB1Q8N987 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NECAB1Q8N987 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NECAB1Q8N987 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NECAB1Q8N987 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NECAB1Q8N987 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NECAB1Q8N987 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NECAB1Q8N987 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NECAB1Q8N987 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NECAB1Q8N987 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NECAB1Q8N987 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NECAB1Q8N987 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NECAB1Q8N987 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NECAB1Q8N987 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NECAB1Q8N987 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NECAB1Q8N987 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NECAB1Q8N987 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NECAB1Q8N987 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NECAB1Q8N987 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NECAB1Q8N987 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NECAB1Q8N987 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NECAB1Q8N987 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NECAB1Q8N987 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NECAB1Q8N987 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NECAB1Q8N987 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NECAB1Q8N987 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NECAB1Q8N987 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NECAB1Q8N987 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NECAB1Q8N987 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NECAB1Q8N987 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NECAB1Q8N987 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NECAB1Q8N987 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NECAB1Q8N987 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms