Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2G4

LYPD1, Ly6/PLAUR domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD1Q8N2G4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LYPD1Q8N2G4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LYPD1Q8N2G4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LYPD1Q8N2G4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYPD1Q8N2G4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYPD1Q8N2G4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYPD1Q8N2G4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LYPD1Q8N2G4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYPD1Q8N2G4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYPD1Q8N2G4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYPD1Q8N2G4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYPD1Q8N2G4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYPD1Q8N2G4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYPD1Q8N2G4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYPD1Q8N2G4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYPD1Q8N2G4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYPD1Q8N2G4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYPD1Q8N2G4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYPD1Q8N2G4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYPD1Q8N2G4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LYPD1Q8N2G4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYPD1Q8N2G4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LYPD1Q8N2G4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYPD1Q8N2G4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYPD1Q8N2G4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYPD1Q8N2G4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYPD1Q8N2G4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYPD1Q8N2G4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LYPD1Q8N2G4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYPD1Q8N2G4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYPD1Q8N2G4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD1Q8N2G4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD1Q8N2G4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD1Q8N2G4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD1Q8N2G4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD1Q8N2G4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD1Q8N2G4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYPD1Q8N2G4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYPD1Q8N2G4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD1Q8N2G4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD1Q8N2G4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD1Q8N2G4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD1Q8N2G4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYPD1Q8N2G4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYPD1Q8N2G4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD1Q8N2G4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD1Q8N2G4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD1Q8N2G4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD1Q8N2G4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD1Q8N2G4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD1Q8N2G4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD1Q8N2G4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYPD1Q8N2G4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD1Q8N2G4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD1Q8N2G4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD1Q8N2G4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD1Q8N2G4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD1Q8N2G4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYPD1Q8N2G4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD1Q8N2G4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD1Q8N2G4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD1Q8N2G4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD1Q8N2G4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD1Q8N2G4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD1Q8N2G4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYPD1Q8N2G4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYPD1Q8N2G4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYPD1Q8N2G4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD1Q8N2G4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD1Q8N2G4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD1Q8N2G4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD1Q8N2G4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD1Q8N2G4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD1Q8N2G4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD1Q8N2G4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LYPD1Q8N2G4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD1Q8N2G4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD1Q8N2G4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD1Q8N2G4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD1Q8N2G4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD1Q8N2G4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD1Q8N2G4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD1Q8N2G4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD1Q8N2G4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD1Q8N2G4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD1Q8N2G4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD1Q8N2G4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD1Q8N2G4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD1Q8N2G4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD1Q8N2G4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD1Q8N2G4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD1Q8N2G4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD1Q8N2G4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD1Q8N2G4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD1Q8N2G4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD1Q8N2G4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYPD1Q8N2G4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYPD1Q8N2G4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYPD1Q8N2G4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYPD1Q8N2G4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms