Protein–RNA interactions for Protein: Q86W33

TPRA1, Transmembrane protein adipocyte-associated 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1Q86W33 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPRA1Q86W33 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPRA1Q86W33 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPRA1Q86W33 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPRA1Q86W33 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPRA1Q86W33 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPRA1Q86W33 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRA1Q86W33 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRA1Q86W33 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPRA1Q86W33 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPRA1Q86W33 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TPRA1Q86W33 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRA1Q86W33 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPRA1Q86W33 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPRA1Q86W33 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPRA1Q86W33 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPRA1Q86W33 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRA1Q86W33 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPRA1Q86W33 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPRA1Q86W33 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPRA1Q86W33 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRA1Q86W33 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TPRA1Q86W33 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPRA1Q86W33 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRA1Q86W33 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPRA1Q86W33 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPRA1Q86W33 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPRA1Q86W33 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRA1Q86W33 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRA1Q86W33 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRA1Q86W33 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRA1Q86W33 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRA1Q86W33 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRA1Q86W33 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPRA1Q86W33 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPRA1Q86W33 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRA1Q86W33 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRA1Q86W33 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPRA1Q86W33 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPRA1Q86W33 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRA1Q86W33 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRA1Q86W33 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRA1Q86W33 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPRA1Q86W33 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPRA1Q86W33 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPRA1Q86W33 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPRA1Q86W33 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRA1Q86W33 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPRA1Q86W33 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPRA1Q86W33 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRA1Q86W33 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPRA1Q86W33 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRA1Q86W33 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRA1Q86W33 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRA1Q86W33 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPRA1Q86W33 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRA1Q86W33 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRA1Q86W33 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRA1Q86W33 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPRA1Q86W33 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRA1Q86W33 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPRA1Q86W33 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPRA1Q86W33 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRA1Q86W33 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRA1Q86W33 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRA1Q86W33 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRA1Q86W33 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRA1Q86W33 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPRA1Q86W33 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRA1Q86W33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPRA1Q86W33 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPRA1Q86W33 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPRA1Q86W33 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRA1Q86W33 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPRA1Q86W33 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TPRA1Q86W33 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRA1Q86W33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRA1Q86W33 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRA1Q86W33 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRA1Q86W33 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRA1Q86W33 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPRA1Q86W33 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRA1Q86W33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRA1Q86W33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRA1Q86W33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRA1Q86W33 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRA1Q86W33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRA1Q86W33 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRA1Q86W33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRA1Q86W33 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRA1Q86W33 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRA1Q86W33 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRA1Q86W33 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRA1Q86W33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRA1Q86W33 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRA1Q86W33 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPRA1Q86W33 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRA1Q86W33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRA1Q86W33 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRA1Q86W33 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms