Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW0

SESTD1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESTD1Q86VW0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SESTD1Q86VW0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SESTD1Q86VW0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SESTD1Q86VW0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SESTD1Q86VW0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SESTD1Q86VW0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SESTD1Q86VW0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SESTD1Q86VW0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SESTD1Q86VW0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SESTD1Q86VW0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SESTD1Q86VW0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SESTD1Q86VW0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SESTD1Q86VW0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SESTD1Q86VW0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SESTD1Q86VW0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SESTD1Q86VW0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SESTD1Q86VW0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SESTD1Q86VW0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SESTD1Q86VW0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SESTD1Q86VW0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SESTD1Q86VW0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SESTD1Q86VW0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SESTD1Q86VW0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SESTD1Q86VW0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SESTD1Q86VW0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SESTD1Q86VW0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SESTD1Q86VW0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SESTD1Q86VW0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SESTD1Q86VW0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SESTD1Q86VW0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SESTD1Q86VW0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SESTD1Q86VW0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SESTD1Q86VW0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SESTD1Q86VW0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SESTD1Q86VW0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SESTD1Q86VW0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SESTD1Q86VW0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SESTD1Q86VW0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SESTD1Q86VW0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SESTD1Q86VW0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SESTD1Q86VW0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SESTD1Q86VW0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SESTD1Q86VW0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SESTD1Q86VW0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SESTD1Q86VW0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SESTD1Q86VW0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SESTD1Q86VW0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SESTD1Q86VW0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SESTD1Q86VW0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SESTD1Q86VW0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SESTD1Q86VW0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SESTD1Q86VW0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SESTD1Q86VW0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SESTD1Q86VW0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SESTD1Q86VW0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SESTD1Q86VW0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SESTD1Q86VW0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SESTD1Q86VW0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SESTD1Q86VW0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SESTD1Q86VW0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SESTD1Q86VW0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SESTD1Q86VW0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SESTD1Q86VW0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SESTD1Q86VW0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SESTD1Q86VW0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SESTD1Q86VW0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SESTD1Q86VW0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SESTD1Q86VW0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SESTD1Q86VW0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SESTD1Q86VW0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SESTD1Q86VW0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SESTD1Q86VW0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SESTD1Q86VW0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SESTD1Q86VW0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SESTD1Q86VW0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SESTD1Q86VW0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SESTD1Q86VW0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SESTD1Q86VW0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SESTD1Q86VW0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SESTD1Q86VW0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SESTD1Q86VW0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SESTD1Q86VW0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SESTD1Q86VW0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SESTD1Q86VW0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SESTD1Q86VW0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SESTD1Q86VW0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SESTD1Q86VW0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SESTD1Q86VW0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SESTD1Q86VW0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SESTD1Q86VW0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SESTD1Q86VW0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SESTD1Q86VW0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms