Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5Y7

KCTD20, BTB/POZ domain-containing protein KCTD20, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD20Q7Z5Y7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCTD20Q7Z5Y7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCTD20Q7Z5Y7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCTD20Q7Z5Y7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCTD20Q7Z5Y7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCTD20Q7Z5Y7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KCTD20Q7Z5Y7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCTD20Q7Z5Y7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCTD20Q7Z5Y7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCTD20Q7Z5Y7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCTD20Q7Z5Y7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCTD20Q7Z5Y7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCTD20Q7Z5Y7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCTD20Q7Z5Y7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCTD20Q7Z5Y7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCTD20Q7Z5Y7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCTD20Q7Z5Y7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCTD20Q7Z5Y7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD20Q7Z5Y7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCTD20Q7Z5Y7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCTD20Q7Z5Y7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCTD20Q7Z5Y7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCTD20Q7Z5Y7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCTD20Q7Z5Y7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCTD20Q7Z5Y7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCTD20Q7Z5Y7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCTD20Q7Z5Y7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCTD20Q7Z5Y7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCTD20Q7Z5Y7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCTD20Q7Z5Y7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCTD20Q7Z5Y7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCTD20Q7Z5Y7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCTD20Q7Z5Y7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCTD20Q7Z5Y7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCTD20Q7Z5Y7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCTD20Q7Z5Y7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCTD20Q7Z5Y7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCTD20Q7Z5Y7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD20Q7Z5Y7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD20Q7Z5Y7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD20Q7Z5Y7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD20Q7Z5Y7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCTD20Q7Z5Y7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCTD20Q7Z5Y7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCTD20Q7Z5Y7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCTD20Q7Z5Y7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCTD20Q7Z5Y7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCTD20Q7Z5Y7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCTD20Q7Z5Y7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD20Q7Z5Y7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCTD20Q7Z5Y7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCTD20Q7Z5Y7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCTD20Q7Z5Y7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCTD20Q7Z5Y7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCTD20Q7Z5Y7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCTD20Q7Z5Y7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCTD20Q7Z5Y7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCTD20Q7Z5Y7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCTD20Q7Z5Y7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCTD20Q7Z5Y7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCTD20Q7Z5Y7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCTD20Q7Z5Y7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCTD20Q7Z5Y7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCTD20Q7Z5Y7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCTD20Q7Z5Y7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCTD20Q7Z5Y7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCTD20Q7Z5Y7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCTD20Q7Z5Y7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD20Q7Z5Y7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD20Q7Z5Y7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD20Q7Z5Y7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCTD20Q7Z5Y7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCTD20Q7Z5Y7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCTD20Q7Z5Y7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCTD20Q7Z5Y7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCTD20Q7Z5Y7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCTD20Q7Z5Y7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD20Q7Z5Y7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD20Q7Z5Y7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD20Q7Z5Y7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD20Q7Z5Y7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD20Q7Z5Y7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD20Q7Z5Y7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD20Q7Z5Y7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD20Q7Z5Y7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD20Q7Z5Y7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD20Q7Z5Y7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD20Q7Z5Y7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD20Q7Z5Y7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD20Q7Z5Y7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD20Q7Z5Y7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD20Q7Z5Y7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD20Q7Z5Y7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD20Q7Z5Y7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD20Q7Z5Y7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCTD20Q7Z5Y7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCTD20Q7Z5Y7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCTD20Q7Z5Y7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCTD20Q7Z5Y7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCTD20Q7Z5Y7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms