Protein–RNA interactions for Protein: Q75T13

PGAP1, GPI inositol-deacylase, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP1Q75T13 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PGAP1Q75T13 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PGAP1Q75T13 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PGAP1Q75T13 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PGAP1Q75T13 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PGAP1Q75T13 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PGAP1Q75T13 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGAP1Q75T13 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PGAP1Q75T13 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGAP1Q75T13 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGAP1Q75T13 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGAP1Q75T13 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGAP1Q75T13 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGAP1Q75T13 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGAP1Q75T13 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGAP1Q75T13 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGAP1Q75T13 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGAP1Q75T13 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGAP1Q75T13 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGAP1Q75T13 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGAP1Q75T13 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGAP1Q75T13 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGAP1Q75T13 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGAP1Q75T13 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGAP1Q75T13 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGAP1Q75T13 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGAP1Q75T13 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGAP1Q75T13 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGAP1Q75T13 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGAP1Q75T13 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGAP1Q75T13 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGAP1Q75T13 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGAP1Q75T13 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGAP1Q75T13 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGAP1Q75T13 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGAP1Q75T13 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGAP1Q75T13 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGAP1Q75T13 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGAP1Q75T13 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGAP1Q75T13 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGAP1Q75T13 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGAP1Q75T13 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGAP1Q75T13 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGAP1Q75T13 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGAP1Q75T13 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGAP1Q75T13 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGAP1Q75T13 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGAP1Q75T13 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGAP1Q75T13 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGAP1Q75T13 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGAP1Q75T13 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGAP1Q75T13 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGAP1Q75T13 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGAP1Q75T13 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGAP1Q75T13 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGAP1Q75T13 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGAP1Q75T13 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGAP1Q75T13 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGAP1Q75T13 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGAP1Q75T13 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGAP1Q75T13 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGAP1Q75T13 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGAP1Q75T13 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGAP1Q75T13 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGAP1Q75T13 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAP1Q75T13 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAP1Q75T13 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAP1Q75T13 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAP1Q75T13 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAP1Q75T13 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAP1Q75T13 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGAP1Q75T13 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGAP1Q75T13 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PGAP1Q75T13 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGAP1Q75T13 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP1Q75T13 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGAP1Q75T13 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGAP1Q75T13 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP1Q75T13 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGAP1Q75T13 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGAP1Q75T13 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGAP1Q75T13 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAP1Q75T13 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAP1Q75T13 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAP1Q75T13 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGAP1Q75T13 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAP1Q75T13 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAP1Q75T13 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGAP1Q75T13 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGAP1Q75T13 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAP1Q75T13 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAP1Q75T13 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PGAP1Q75T13 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGAP1Q75T13 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGAP1Q75T13 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PGAP1Q75T13 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGAP1Q75T13 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGAP1Q75T13 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGAP1Q75T13 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGAP1Q75T13 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms