Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF165Q6ZSG1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF165Q6ZSG1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RNF165Q6ZSG1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RNF165Q6ZSG1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
RNF165Q6ZSG1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF165Q6ZSG1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF165Q6ZSG1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RNF165Q6ZSG1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RNF165Q6ZSG1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RNF165Q6ZSG1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF165Q6ZSG1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RNF165Q6ZSG1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
RNF165Q6ZSG1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RNF165Q6ZSG1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF165Q6ZSG1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF165Q6ZSG1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF165Q6ZSG1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF165Q6ZSG1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF165Q6ZSG1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF165Q6ZSG1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF165Q6ZSG1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF165Q6ZSG1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF165Q6ZSG1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF165Q6ZSG1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF165Q6ZSG1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF165Q6ZSG1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF165Q6ZSG1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF165Q6ZSG1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF165Q6ZSG1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF165Q6ZSG1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF165Q6ZSG1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNF165Q6ZSG1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF165Q6ZSG1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF165Q6ZSG1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF165Q6ZSG1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF165Q6ZSG1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF165Q6ZSG1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF165Q6ZSG1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF165Q6ZSG1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF165Q6ZSG1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF165Q6ZSG1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF165Q6ZSG1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF165Q6ZSG1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF165Q6ZSG1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF165Q6ZSG1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF165Q6ZSG1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF165Q6ZSG1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF165Q6ZSG1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF165Q6ZSG1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF165Q6ZSG1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF165Q6ZSG1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF165Q6ZSG1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF165Q6ZSG1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF165Q6ZSG1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF165Q6ZSG1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF165Q6ZSG1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF165Q6ZSG1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF165Q6ZSG1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF165Q6ZSG1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF165Q6ZSG1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF165Q6ZSG1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF165Q6ZSG1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF165Q6ZSG1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF165Q6ZSG1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF165Q6ZSG1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF165Q6ZSG1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF165Q6ZSG1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF165Q6ZSG1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF165Q6ZSG1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF165Q6ZSG1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF165Q6ZSG1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF165Q6ZSG1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF165Q6ZSG1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF165Q6ZSG1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF165Q6ZSG1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF165Q6ZSG1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF165Q6ZSG1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF165Q6ZSG1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF165Q6ZSG1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF165Q6ZSG1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF165Q6ZSG1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF165Q6ZSG1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF165Q6ZSG1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF165Q6ZSG1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF165Q6ZSG1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF165Q6ZSG1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF165Q6ZSG1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF165Q6ZSG1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF165Q6ZSG1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms