Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SNX1Q13596 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SNX1Q13596 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SNX1Q13596 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SNX1Q13596 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SNX1Q13596 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNX1Q13596 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNX1Q13596 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SNX1Q13596 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SNX1Q13596 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNX1Q13596 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SNX1Q13596 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNX1Q13596 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SNX1Q13596 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SNX1Q13596 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNX1Q13596 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNX1Q13596 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SNX1Q13596 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SNX1Q13596 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SNX1Q13596 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SNX1Q13596 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SNX1Q13596 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SNX1Q13596 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SNX1Q13596 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SNX1Q13596 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SNX1Q13596 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SNX1Q13596 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SNX1Q13596 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SNX1Q13596 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNX1Q13596 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SNX1Q13596 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SNX1Q13596 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SNX1Q13596 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SNX1Q13596 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SNX1Q13596 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX1Q13596 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SNX1Q13596 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SNX1Q13596 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNX1Q13596 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNX1Q13596 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SNX1Q13596 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNX1Q13596 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SNX1Q13596 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SNX1Q13596 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNX1Q13596 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNX1Q13596 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNX1Q13596 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNX1Q13596 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNX1Q13596 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SNX1Q13596 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNX1Q13596 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNX1Q13596 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNX1Q13596 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNX1Q13596 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNX1Q13596 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNX1Q13596 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX1Q13596 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX1Q13596 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX1Q13596 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SNX1Q13596 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNX1Q13596 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNX1Q13596 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX1Q13596 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX1Q13596 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX1Q13596 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX1Q13596 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNX1Q13596 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX1Q13596 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNX1Q13596 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNX1Q13596 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNX1Q13596 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX1Q13596 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX1Q13596 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX1Q13596 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX1Q13596 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX1Q13596 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNX1Q13596 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX1Q13596 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX1Q13596 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX1Q13596 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNX1Q13596 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNX1Q13596 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX1Q13596 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX1Q13596 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX1Q13596 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX1Q13596 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX1Q13596 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX1Q13596 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SNX1Q13596 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX1Q13596 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX1Q13596 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX1Q13596 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
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