Protein–RNA interactions for Protein: Q13303

KCNAB2, Voltage-gated potassium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB2Q13303 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KCNAB2Q13303 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KCNAB2Q13303 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
KCNAB2Q13303 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KCNAB2Q13303 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KCNAB2Q13303 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KCNAB2Q13303 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KCNAB2Q13303 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KCNAB2Q13303 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KCNAB2Q13303 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KCNAB2Q13303 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KCNAB2Q13303 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KCNAB2Q13303 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KCNAB2Q13303 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNAB2Q13303 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNAB2Q13303 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KCNAB2Q13303 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KCNAB2Q13303 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KCNAB2Q13303 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCNAB2Q13303 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNAB2Q13303 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNAB2Q13303 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNAB2Q13303 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNAB2Q13303 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNAB2Q13303 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KCNAB2Q13303 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KCNAB2Q13303 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNAB2Q13303 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNAB2Q13303 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNAB2Q13303 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNAB2Q13303 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNAB2Q13303 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNAB2Q13303 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNAB2Q13303 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNAB2Q13303 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNAB2Q13303 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNAB2Q13303 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNAB2Q13303 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNAB2Q13303 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNAB2Q13303 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNAB2Q13303 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNAB2Q13303 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNAB2Q13303 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNAB2Q13303 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNAB2Q13303 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNAB2Q13303 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNAB2Q13303 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNAB2Q13303 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNAB2Q13303 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNAB2Q13303 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNAB2Q13303 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNAB2Q13303 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNAB2Q13303 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNAB2Q13303 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNAB2Q13303 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNAB2Q13303 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNAB2Q13303 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNAB2Q13303 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNAB2Q13303 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNAB2Q13303 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNAB2Q13303 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNAB2Q13303 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNAB2Q13303 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNAB2Q13303 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNAB2Q13303 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNAB2Q13303 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNAB2Q13303 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNAB2Q13303 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNAB2Q13303 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNAB2Q13303 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNAB2Q13303 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNAB2Q13303 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNAB2Q13303 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNAB2Q13303 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNAB2Q13303 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNAB2Q13303 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNAB2Q13303 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNAB2Q13303 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNAB2Q13303 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNAB2Q13303 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNAB2Q13303 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNAB2Q13303 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNAB2Q13303 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNAB2Q13303 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNAB2Q13303 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNAB2Q13303 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNAB2Q13303 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNAB2Q13303 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNAB2Q13303 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNAB2Q13303 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNAB2Q13303 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNAB2Q13303 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNAB2Q13303 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNAB2Q13303 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNAB2Q13303 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNAB2Q13303 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNAB2Q13303 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNAB2Q13303 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNAB2Q13303 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNAB2Q13303 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.8 ms