Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 NSR1YGR159C 1245 nt16.05■□□□□ 0.16
TY1A-BRQ12217 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.76■□□□□ 0.11
TY1A-BRQ12217 NOP1YDL014W 984 nt15.15■□□□□ 0.02
TY1A-BRQ12217 MDJ1YFL016C 1536 nt15.07■□□□□ 0
TY1A-BRQ12217 YGR139WYGR139W 339 nt14.67□□□□□ -0.06
TY1A-BRQ12217 MOT3YMR070W 1473 nt14.55□□□□□ -0.08
TY1A-BRQ12217 Q0182Q0182 405 nt14.43□□□□□ -0.1
TY1A-BRQ12217 SSA3YBL075C 1950 nt13.75□□□□□ -0.21
TY1A-BRQ12217 NME1NME1 340 nt13.75□□□□□ -0.21
TY1A-BRQ12217 YJL027CYJL027C 417 nt13.71□□□□□ -0.21
TY1A-BRQ12217 YKL036CYKL036C 393 nt13.54□□□□□ -0.24
TY1A-BRQ12217 CSM2YIL132C 642 nt13.26□□□□□ -0.29
TY1A-BRQ12217 SRX1YKL086W 384 nt13.19□□□□□ -0.3
TY1A-BRQ12217 DBP2YNL112W 1641 nt13.11□□□□□ -0.31
TY1A-BRQ12217 Q0297Q0297 156 nt13.06□□□□□ -0.32
TY1A-BRQ12217 PAU21YOR394W 495 nt13.05□□□□□ -0.32
TY1A-BRQ12217 PAU22YPL282C 495 nt13.05□□□□□ -0.32
TY1A-BRQ12217 YBR190WYBR190W 312 nt12.99□□□□□ -0.33
TY1A-BRQ12217 ARO7YPR060C 771 nt12.9□□□□□ -0.34
TY1A-BRQ12217 PAM17YKR065C 594 nt12.68□□□□□ -0.38
TY1A-BRQ12217 RTC3YHR087W 336 nt12.59□□□□□ -0.39
TY1A-BRQ12217 REG2YBR050C 1017 nt12.55□□□□□ -0.4
TY1A-BRQ12217 YCR051WYCR051W 669 nt12.54□□□□□ -0.4
TY1A-BRQ12217 PUT4YOR348C 1884 nt12.53□□□□□ -0.4
TY1A-BRQ12217 YDR509WYDR509W 348 nt12.38□□□□□ -0.43
TY1A-BRQ12217 BUR6YER159C 429 nt12.31□□□□□ -0.44
TY1A-BRQ12217 VAR1Q0140 1197 nt12.31□□□□□ -0.44
TY1A-BRQ12217 BMT5YIL096C 1011 nt12.23□□□□□ -0.45
TY1A-BRQ12217 Q0010Q0010 387 nt12.22□□□□□ -0.45
TY1A-BRQ12217 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-BRQ12217 CCC1YLR220W 969 nt12.14□□□□□ -0.47
TY1A-BRQ12217 ARE1YCR048W 1833 nt12.07□□□□□ -0.48
TY1A-BRQ12217 SCS3YGL126W 1143 nt12.06□□□□□ -0.48
TY1A-BRQ12217 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.05□□□□□ -0.48
TY1A-BRQ12217 SRN2YLR119W 642 nt12.03□□□□□ -0.48
TY1A-BRQ12217 ARA2YMR041C 1008 nt12.02□□□□□ -0.49
TY1A-BRQ12217 POA1YBR022W 534 nt12.02□□□□□ -0.49
TY1A-BRQ12217 SSA4YER103W 1929 nt12.01□□□□□ -0.49
TY1A-BRQ12217 Q0144Q0144 330 nt12□□□□□ -0.49
TY1A-BRQ12217 SEM1YDR363W-A 270 nt11.96□□□□□ -0.49
TY1A-BRQ12217 RVS167YDR388W 1449 nt11.95□□□□□ -0.5
TY1A-BRQ12217 BSC6YOL137W 1494 nt11.91□□□□□ -0.5
TY1A-BRQ12217 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.87□□□□□ -0.51
TY1A-BRQ12217 SCJ1YMR214W 1134 nt11.86□□□□□ -0.51
TY1A-BRQ12217 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.81□□□□□ -0.52
TY1A-BRQ12217 YLR122CYLR122C 378 nt11.8□□□□□ -0.52
TY1A-BRQ12217 SAH1YER043C 1350 nt11.75□□□□□ -0.53
TY1A-BRQ12217 RPP1BYDL130W 321 nt11.74□□□□□ -0.53
TY1A-BRQ12217 BDF1YLR399C 2061 nt11.74□□□□□ -0.53
TY1A-BRQ12217 MET8YBR213W 825 nt11.73□□□□□ -0.53
TY1A-BRQ12217 YOL085CYOL085C 342 nt11.72□□□□□ -0.53
TY1A-BRQ12217 CLB6YGR109C 1143 nt11.71□□□□□ -0.53
TY1A-BRQ12217 ABZ2YMR289W 1125 nt11.69□□□□□ -0.54
TY1A-BRQ12217 ARP10YDR106W 855 nt11.67□□□□□ -0.54
TY1A-BRQ12217 PKP1YIL042C 1185 nt11.64□□□□□ -0.55
TY1A-BRQ12217 URN1YPR152C 1398 nt11.6□□□□□ -0.55
TY1A-BRQ12217 TOM20YGR082W 552 nt11.58□□□□□ -0.56
TY1A-BRQ12217 YCR099CYCR099C 468 nt11.57□□□□□ -0.56
TY1A-BRQ12217 OPI9YLR338W 858 nt11.57□□□□□ -0.56
TY1A-BRQ12217 TAT1YBR069C 1860 nt11.51□□□□□ -0.57
TY1A-BRQ12217 AI3Q0060 1248 nt11.49□□□□□ -0.57
TY1A-BRQ12217 UTP6YDR449C 1323 nt11.46□□□□□ -0.57
TY1A-BRQ12217 BUD23YCR047C 828 nt11.43□□□□□ -0.58
TY1A-BRQ12217 PET20YPL159C 762 nt11.43□□□□□ -0.58
TY1A-BRQ12217 URH1YDR400W 1023 nt11.42□□□□□ -0.58
TY1A-BRQ12217 LCP5YER127W 1074 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1A-BRQ12217 PAC11YDR488C 1602 nt11.39□□□□□ -0.59
TY1A-BRQ12217 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.39□□□□□ -0.59
TY1A-BRQ12217 SHR5YOL110W 714 nt11.39□□□□□ -0.59
TY1A-BRQ12217 DEP1YAL013W 1218 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1A-BRQ12217 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.35□□□□□ -0.59
TY1A-BRQ12217 SKG1YKR100C 1068 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1A-BRQ12217 HMT1YBR034C 1047 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1A-BRQ12217 Q0142Q0142 177 nt11.32□□□□□ -0.6
TY1A-BRQ12217 snR78snR78 87 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1A-BRQ12217 MEP2YNL142W 1500 nt11.27□□□□□ -0.61
TY1A-BRQ12217 PET122YER153C 765 nt11.26□□□□□ -0.61
TY1A-BRQ12217 PTC2YER089C 1395 nt11.24□□□□□ -0.61
TY1A-BRQ12217 NVJ2YPR091C 2313 nt11.23□□□□□ -0.61
TY1A-BRQ12217 YPL071CYPL071C 471 nt11.22□□□□□ -0.61
TY1A-BRQ12217 YNR068CYNR068C 819 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1A-BRQ12217 NAB2YGL122C 1578 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1A-BRQ12217 PUN1YLR414C 792 nt11.15□□□□□ -0.62
TY1A-BRQ12217 DCW1YKL046C 1350 nt11.14□□□□□ -0.63
TY1A-BRQ12217 Q0255Q0255 1419 nt11.12□□□□□ -0.63
TY1A-BRQ12217 RPN10YHR200W 807 nt11.11□□□□□ -0.63
TY1A-BRQ12217 YHM2YMR241W 945 nt11.1□□□□□ -0.63
TY1A-BRQ12217 YPL168WYPL168W 1293 nt11.1□□□□□ -0.63
TY1A-BRQ12217 YJL118WYJL118W 660 nt11.09□□□□□ -0.63
TY1A-BRQ12217 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.08□□□□□ -0.64
TY1A-BRQ12217 SCR1SCR1 522 nt11.07□□□□□ -0.64
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