RNA–Protein interactions for RNA: YBR069C

TAT1, Transcript of Amino acid transporter for valine, leucine, isoleucine, and tyrosine, yeastyeast

Gene TAT1, Length 1,860 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAT1YBR069C SGS1P35187 1447 aa19.17■□□□□ 0.66
TAT1YBR069C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
TAT1YBR069C SSN2P38931 1420 aa18.86■□□□□ 0.61
TAT1YBR069C INO80P53115 1489 aa18.42■□□□□ 0.54
TAT1YBR069C DRS1P32892 752 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TAT1YBR069C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TAT1YBR069C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TAT1YBR069C NOP2P40991 618 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
TAT1YBR069C TY1B-DR4Q07793 1604 aa17.48■□□□□ 0.39
TAT1YBR069C MMS22Q06164 1454 aa17.48■□□□□ 0.39
TAT1YBR069C HSL1P34244 1518 aa17.44■□□□□ 0.38
TAT1YBR069C CHD1P32657 1468 aa17.42■□□□□ 0.38
TAT1YBR069C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data17.37■□□□□ 0.37not detected
TAT1YBR069C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TAT1YBR069C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
TAT1YBR069C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TAT1YBR069C HIR3P47171 1648 aa17.19■□□□□ 0.34
TAT1YBR069C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TAT1YBR069C THO2P53552 1597 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
TAT1YBR069C UFD4P33202 1483 aa17.1■□□□□ 0.33
TAT1YBR069C REV3P14284 1504 aa17.1■□□□□ 0.33
TAT1YBR069C SIN3P22579 1536 aa16.98■□□□□ 0.31
TAT1YBR069C SSK2P53599 1579 aa16.98■□□□□ 0.31
TAT1YBR069C SWR1Q05471 1514 aa16.96■□□□□ 0.31
TAT1YBR069C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TAT1YBR069C TAF2P23255 1407 aa16.93■□□□□ 0.3
TAT1YBR069C TRM732Q03496 1420 aa16.92■□□□□ 0.3
TAT1YBR069C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TAT1YBR069C STU1P38198 1513 aa16.87■□□□□ 0.29
TAT1YBR069C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TAT1YBR069C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TAT1YBR069C ESP1Q03018 1630 aa16.77■□□□□ 0.28
TAT1YBR069C YTA7P40340 1379 aa16.76■□□□□ 0.27
TAT1YBR069C POL1P13382 1468 aa16.76■□□□□ 0.27
TAT1YBR069C SPP41P38904 1435 aa16.76■□□□□ 0.27
TAT1YBR069C BPT1P14772 1559 aa16.73■□□□□ 0.27
TAT1YBR069C ENP1P38333 483 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
TAT1YBR069C SCC2Q04002 1493 aa16.63■□□□□ 0.25
TAT1YBR069C SSM4P40318 1319 aa16.56■□□□□ 0.24
TAT1YBR069C POL5P39985 1022 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TAT1YBR069C NUP170P38181 1502 aa16.52■□□□□ 0.23
TAT1YBR069C DNA2P38859 1522 aa16.5■□□□□ 0.23
TAT1YBR069C MYO4P32492 1471 aa16.46■□□□□ 0.23
TAT1YBR069C ECM5Q03214 1411 aa16.46■□□□□ 0.23
TAT1YBR069C KOG1P38873 1557 aa16.45■□□□□ 0.22
TAT1YBR069C YPK9Q12697 1472 aa16.43■□□□□ 0.22
TAT1YBR069C RKR1Q04781 1562 aa16.43■□□□□ 0.22
TAT1YBR069C YOR1P53049 1477 aa16.43■□□□□ 0.22
TAT1YBR069C STH1P32597 1359 aa16.39■□□□□ 0.21
TAT1YBR069C SPT7P35177 1332 aa16.39■□□□□ 0.21
TAT1YBR069C BUD4P47136 1447 aa16.35■□□□□ 0.21
TAT1YBR069C TAF7Q05021 590 aa16.35■□□□□ 0.21
TAT1YBR069C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TAT1YBR069C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TAT1YBR069C SMC4Q12267 1418 aa16.31■□□□□ 0.2
TAT1YBR069C PAN1P32521 1480 aa16.31■□□□□ 0.2
TAT1YBR069C ATG2P53855 1592 aa16.3■□□□□ 0.2
TAT1YBR069C RTT106P40161 455 aa16.29■□□□□ 0.2
TAT1YBR069C MLP2P40457 1679 aa16.24■□□□□ 0.19
TAT1YBR069C IFH1P39520 1085 aa16.22■□□□□ 0.19
TAT1YBR069C PDR10P51533 1564 aa16.22■□□□□ 0.19
TAT1YBR069C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TAT1YBR069C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TAT1YBR069C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TAT1YBR069C TSC11P40061 1430 aa16.15■□□□□ 0.18
TAT1YBR069C PRS1P32895 427 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TAT1YBR069C CAB3P36076 571 aa16.14■□□□□ 0.17
TAT1YBR069C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TAT1YBR069C RPO31P04051 1460 aa16.09■□□□□ 0.17
TAT1YBR069C PEP1P32319 1579 aa16.06■□□□□ 0.16
TAT1YBR069C EBP2P36049 427 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TAT1YBR069C YPR148CQ06523 435 aa16.05■□□□□ 0.16
TAT1YBR069C LEU3P08638 886 aa16.02■□□□□ 0.16
TAT1YBR069C ULS1Q08562 1619 aa16.02■□□□□ 0.15
TAT1YBR069C TY1B-DR3Q99231 1755 aa15.98■□□□□ 0.15
TAT1YBR069C TY3B-GQ99315 1547 aa15.95■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-FP0CX63 1770 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-CP25384 1770 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-DR2Q03494 1770 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY1B-DR1Q03855 1755 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-OR1Q12113 1770 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-DR1Q12472 1770 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TY2B-OR2Q12501 1770 aa15.92■□□□□ 0.14
TAT1YBR069C TFA1P36100 482 aa15.89■□□□□ 0.13
TAT1YBR069C VPS15P22219 1454 aa15.88■□□□□ 0.13
TAT1YBR069C SRB8P25648 1427 aa15.88■□□□□ 0.13
TAT1YBR069C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TAT1YBR069C DNF1P32660 1571 aa15.85■□□□□ 0.13
TAT1YBR069C MDS3P53094 1487 aa15.84■□□□□ 0.13
TAT1YBR069C TY2B-BQ12491 1770 aa15.83■□□□□ 0.12
TAT1YBR069C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
TAT1YBR069C NUP159P40477 1460 aa15.82■□□□□ 0.12
TAT1YBR069C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
TAT1YBR069C YBT1P32386 1661 aa15.75■□□□□ 0.11
TAT1YBR069C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TAT1YBR069C MHP1P43638 1398 aa15.72■□□□□ 0.11
TAT1YBR069C IME2P32581 645 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9 ms