Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP6V0D1P61421 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP6V0D1P61421 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP6V0D1P61421 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATP6V0D1P61421 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATP6V0D1P61421 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP6V0D1P61421 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP6V0D1P61421 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP6V0D1P61421 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ATP6V0D1P61421 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ATP6V0D1P61421 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP6V0D1P61421 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ATP6V0D1P61421 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP6V0D1P61421 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP6V0D1P61421 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP6V0D1P61421 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ATP6V0D1P61421 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP6V0D1P61421 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP6V0D1P61421 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP6V0D1P61421 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP6V0D1P61421 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATP6V0D1P61421 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP6V0D1P61421 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP6V0D1P61421 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP6V0D1P61421 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP6V0D1P61421 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP6V0D1P61421 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP6V0D1P61421 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP6V0D1P61421 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP6V0D1P61421 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP6V0D1P61421 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP6V0D1P61421 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP6V0D1P61421 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP6V0D1P61421 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP6V0D1P61421 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP6V0D1P61421 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP6V0D1P61421 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP6V0D1P61421 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP6V0D1P61421 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP6V0D1P61421 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP6V0D1P61421 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP6V0D1P61421 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP6V0D1P61421 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP6V0D1P61421 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP6V0D1P61421 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP6V0D1P61421 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP6V0D1P61421 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP6V0D1P61421 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP6V0D1P61421 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP6V0D1P61421 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP6V0D1P61421 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP6V0D1P61421 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP6V0D1P61421 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP6V0D1P61421 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP6V0D1P61421 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP6V0D1P61421 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP6V0D1P61421 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP6V0D1P61421 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP6V0D1P61421 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP6V0D1P61421 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP6V0D1P61421 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP6V0D1P61421 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP6V0D1P61421 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP6V0D1P61421 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP6V0D1P61421 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP6V0D1P61421 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP6V0D1P61421 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP6V0D1P61421 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP6V0D1P61421 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP6V0D1P61421 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP6V0D1P61421 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP6V0D1P61421 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP6V0D1P61421 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP6V0D1P61421 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP6V0D1P61421 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP6V0D1P61421 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP6V0D1P61421 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP6V0D1P61421 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP6V0D1P61421 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP6V0D1P61421 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP6V0D1P61421 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP6V0D1P61421 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP6V0D1P61421 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP6V0D1P61421 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP6V0D1P61421 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP6V0D1P61421 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP6V0D1P61421 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP6V0D1P61421 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP6V0D1P61421 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP6V0D1P61421 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP6V0D1P61421 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP6V0D1P61421 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP6V0D1P61421 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP6V0D1P61421 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP6V0D1P61421 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP6V0D1P61421 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP6V0D1P61421 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP6V0D1P61421 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP6V0D1P61421 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP6V0D1P61421 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms