Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEFB1P60022 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEFB1P60022 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DEFB1P60022 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEFB1P60022 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEFB1P60022 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEFB1P60022 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEFB1P60022 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEFB1P60022 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEFB1P60022 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB1P60022 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB1P60022 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFB1P60022 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEFB1P60022 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEFB1P60022 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEFB1P60022 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEFB1P60022 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEFB1P60022 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEFB1P60022 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEFB1P60022 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEFB1P60022 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEFB1P60022 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEFB1P60022 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEFB1P60022 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEFB1P60022 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEFB1P60022 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEFB1P60022 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEFB1P60022 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEFB1P60022 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEFB1P60022 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFB1P60022 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFB1P60022 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEFB1P60022 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEFB1P60022 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEFB1P60022 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEFB1P60022 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEFB1P60022 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB1P60022 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFB1P60022 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFB1P60022 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFB1P60022 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFB1P60022 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEFB1P60022 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEFB1P60022 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEFB1P60022 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFB1P60022 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEFB1P60022 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEFB1P60022 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFB1P60022 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFB1P60022 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEFB1P60022 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEFB1P60022 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFB1P60022 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEFB1P60022 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEFB1P60022 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEFB1P60022 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFB1P60022 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEFB1P60022 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFB1P60022 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFB1P60022 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFB1P60022 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFB1P60022 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFB1P60022 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEFB1P60022 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFB1P60022 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFB1P60022 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFB1P60022 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFB1P60022 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFB1P60022 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEFB1P60022 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFB1P60022 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFB1P60022 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFB1P60022 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFB1P60022 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFB1P60022 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFB1P60022 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFB1P60022 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFB1P60022 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFB1P60022 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFB1P60022 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFB1P60022 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFB1P60022 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEFB1P60022 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFB1P60022 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFB1P60022 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFB1P60022 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFB1P60022 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFB1P60022 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFB1P60022 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEFB1P60022 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFB1P60022 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFB1P60022 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFB1P60022 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFB1P60022 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFB1P60022 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFB1P60022 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFB1P60022 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFB1P60022 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFB1P60022 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEFB1P60022 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms