Protein–RNA interactions for Protein: P49116

NR2C2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C2P49116 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NR2C2P49116 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NR2C2P49116 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NR2C2P49116 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NR2C2P49116 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NR2C2P49116 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NR2C2P49116 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NR2C2P49116 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NR2C2P49116 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NR2C2P49116 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NR2C2P49116 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NR2C2P49116 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NR2C2P49116 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NR2C2P49116 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NR2C2P49116 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NR2C2P49116 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NR2C2P49116 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NR2C2P49116 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NR2C2P49116 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NR2C2P49116 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NR2C2P49116 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NR2C2P49116 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NR2C2P49116 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NR2C2P49116 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NR2C2P49116 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NR2C2P49116 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NR2C2P49116 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NR2C2P49116 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NR2C2P49116 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NR2C2P49116 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NR2C2P49116 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NR2C2P49116 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NR2C2P49116 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NR2C2P49116 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NR2C2P49116 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NR2C2P49116 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NR2C2P49116 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NR2C2P49116 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NR2C2P49116 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NR2C2P49116 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NR2C2P49116 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NR2C2P49116 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NR2C2P49116 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NR2C2P49116 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NR2C2P49116 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NR2C2P49116 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NR2C2P49116 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NR2C2P49116 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NR2C2P49116 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NR2C2P49116 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NR2C2P49116 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NR2C2P49116 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NR2C2P49116 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NR2C2P49116 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NR2C2P49116 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NR2C2P49116 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NR2C2P49116 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NR2C2P49116 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NR2C2P49116 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NR2C2P49116 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NR2C2P49116 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NR2C2P49116 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NR2C2P49116 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NR2C2P49116 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NR2C2P49116 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NR2C2P49116 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NR2C2P49116 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NR2C2P49116 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NR2C2P49116 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NR2C2P49116 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR2C2P49116 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR2C2P49116 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NR2C2P49116 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NR2C2P49116 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NR2C2P49116 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NR2C2P49116 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NR2C2P49116 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NR2C2P49116 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NR2C2P49116 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NR2C2P49116 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NR2C2P49116 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NR2C2P49116 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NR2C2P49116 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NR2C2P49116 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NR2C2P49116 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NR2C2P49116 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NR2C2P49116 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NR2C2P49116 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR2C2P49116 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NR2C2P49116 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NR2C2P49116 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NR2C2P49116 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR2C2P49116 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NR2C2P49116 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NR2C2P49116 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NR2C2P49116 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR2C2P49116 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR2C2P49116 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR2C2P49116 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR2C2P49116 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms