Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ELK4P28324 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ELK4P28324 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ELK4P28324 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ELK4P28324 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ELK4P28324 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ELK4P28324 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ELK4P28324 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ELK4P28324 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ELK4P28324 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ELK4P28324 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ELK4P28324 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ELK4P28324 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ELK4P28324 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ELK4P28324 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ELK4P28324 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ELK4P28324 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ELK4P28324 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ELK4P28324 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ELK4P28324 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ELK4P28324 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ELK4P28324 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELK4P28324 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ELK4P28324 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ELK4P28324 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ELK4P28324 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELK4P28324 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELK4P28324 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ELK4P28324 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ELK4P28324 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ELK4P28324 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ELK4P28324 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ELK4P28324 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ELK4P28324 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ELK4P28324 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ELK4P28324 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ELK4P28324 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ELK4P28324 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELK4P28324 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELK4P28324 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELK4P28324 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELK4P28324 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ELK4P28324 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ELK4P28324 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELK4P28324 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELK4P28324 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELK4P28324 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELK4P28324 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ELK4P28324 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ELK4P28324 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ELK4P28324 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELK4P28324 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELK4P28324 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELK4P28324 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELK4P28324 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ELK4P28324 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ELK4P28324 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ELK4P28324 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELK4P28324 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELK4P28324 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELK4P28324 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELK4P28324 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ELK4P28324 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ELK4P28324 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELK4P28324 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ELK4P28324 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ELK4P28324 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ELK4P28324 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ELK4P28324 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ELK4P28324 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ELK4P28324 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELK4P28324 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELK4P28324 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELK4P28324 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELK4P28324 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ELK4P28324 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ELK4P28324 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ELK4P28324 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ELK4P28324 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELK4P28324 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELK4P28324 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ELK4P28324 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ELK4P28324 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELK4P28324 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ELK4P28324 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ELK4P28324 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELK4P28324 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELK4P28324 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELK4P28324 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELK4P28324 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ELK4P28324 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ELK4P28324 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ELK4P28324 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ELK4P28324 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ELK4P28324 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ELK4P28324 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELK4P28324 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ELK4P28324 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELK4P28324 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ELK4P28324 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms