Protein–RNA interactions for Protein: P10412

HIST1H1E, Histone H1.4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1EP10412 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIST1H1EP10412 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIST1H1EP10412 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIST1H1EP10412 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIST1H1EP10412 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIST1H1EP10412 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIST1H1EP10412 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HIST1H1EP10412 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIST1H1EP10412 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIST1H1EP10412 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIST1H1EP10412 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST1H1EP10412 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST1H1EP10412 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIST1H1EP10412 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST1H1EP10412 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIST1H1EP10412 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIST1H1EP10412 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIST1H1EP10412 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIST1H1EP10412 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIST1H1EP10412 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIST1H1EP10412 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIST1H1EP10412 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST1H1EP10412 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIST1H1EP10412 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST1H1EP10412 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST1H1EP10412 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST1H1EP10412 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIST1H1EP10412 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST1H1EP10412 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST1H1EP10412 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIST1H1EP10412 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST1H1EP10412 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST1H1EP10412 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H1EP10412 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIST1H1EP10412 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST1H1EP10412 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST1H1EP10412 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST1H1EP10412 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST1H1EP10412 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST1H1EP10412 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST1H1EP10412 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST1H1EP10412 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST1H1EP10412 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST1H1EP10412 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST1H1EP10412 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST1H1EP10412 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST1H1EP10412 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST1H1EP10412 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST1H1EP10412 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST1H1EP10412 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H1EP10412 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H1EP10412 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST1H1EP10412 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H1EP10412 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST1H1EP10412 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST1H1EP10412 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H1EP10412 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H1EP10412 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H1EP10412 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H1EP10412 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H1EP10412 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H1EP10412 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H1EP10412 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST1H1EP10412 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST1H1EP10412 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H1EP10412 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST1H1EP10412 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST1H1EP10412 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST1H1EP10412 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST1H1EP10412 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H1EP10412 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H1EP10412 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H1EP10412 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H1EP10412 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H1EP10412 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H1EP10412 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H1EP10412 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H1EP10412 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1EP10412 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1EP10412 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1EP10412 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H1EP10412 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1EP10412 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1EP10412 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1EP10412 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1EP10412 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1EP10412 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H1EP10412 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H1EP10412 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H1EP10412 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H1EP10412 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST1H1EP10412 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST1H1EP10412 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST1H1EP10412 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H1EP10412 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST1H1EP10412 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H1EP10412 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H1EP10412 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H1EP10412 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H1EP10412 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms