Protein–RNA interactions for Protein: P01597

IGKV1-39, Immunoglobulin kappa variable 1-39, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-39P01597 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGKV1-39P01597 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV1-39P01597 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGKV1-39P01597 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGKV1-39P01597 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGKV1-39P01597 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IGKV1-39P01597 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGKV1-39P01597 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGKV1-39P01597 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGKV1-39P01597 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGKV1-39P01597 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGKV1-39P01597 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGKV1-39P01597 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
IGKV1-39P01597 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGKV1-39P01597 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGKV1-39P01597 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGKV1-39P01597 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGKV1-39P01597 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGKV1-39P01597 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGKV1-39P01597 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGKV1-39P01597 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGKV1-39P01597 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGKV1-39P01597 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGKV1-39P01597 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGKV1-39P01597 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGKV1-39P01597 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGKV1-39P01597 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGKV1-39P01597 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGKV1-39P01597 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGKV1-39P01597 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGKV1-39P01597 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGKV1-39P01597 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGKV1-39P01597 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGKV1-39P01597 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGKV1-39P01597 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV1-39P01597 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGKV1-39P01597 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGKV1-39P01597 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGKV1-39P01597 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGKV1-39P01597 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGKV1-39P01597 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGKV1-39P01597 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGKV1-39P01597 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGKV1-39P01597 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1-39P01597 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV1-39P01597 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV1-39P01597 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1-39P01597 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV1-39P01597 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1-39P01597 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1-39P01597 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1-39P01597 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGKV1-39P01597 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGKV1-39P01597 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGKV1-39P01597 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGKV1-39P01597 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGKV1-39P01597 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV1-39P01597 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGKV1-39P01597 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV1-39P01597 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGKV1-39P01597 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGKV1-39P01597 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGKV1-39P01597 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV1-39P01597 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGKV1-39P01597 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGKV1-39P01597 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1-39P01597 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1-39P01597 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV1-39P01597 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGKV1-39P01597 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1-39P01597 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV1-39P01597 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1-39P01597 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGKV1-39P01597 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGKV1-39P01597 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGKV1-39P01597 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGKV1-39P01597 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGKV1-39P01597 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGKV1-39P01597 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGKV1-39P01597 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGKV1-39P01597 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGKV1-39P01597 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGKV1-39P01597 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGKV1-39P01597 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGKV1-39P01597 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV1-39P01597 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV1-39P01597 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGKV1-39P01597 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGKV1-39P01597 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV1-39P01597 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IGKV1-39P01597 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGKV1-39P01597 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGKV1-39P01597 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1-39P01597 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV1-39P01597 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGKV1-39P01597 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV1-39P01597 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1-39P01597 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV1-39P01597 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV1-39P01597 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms