Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFNA1P01562 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNA1P01562 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNA1P01562 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNA1P01562 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNA1P01562 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNA1P01562 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNA1P01562 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNA1P01562 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFNA1P01562 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNA1P01562 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNA1P01562 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNA1P01562 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNA1P01562 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNA1P01562 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNA1P01562 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNA1P01562 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNA1P01562 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNA1P01562 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNA1P01562 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNA1P01562 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNA1P01562 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNA1P01562 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNA1P01562 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNA1P01562 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNA1P01562 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNA1P01562 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNA1P01562 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNA1P01562 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNA1P01562 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNA1P01562 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNA1P01562 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA1P01562 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNA1P01562 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA1P01562 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA1P01562 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA1P01562 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNA1P01562 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA1P01562 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA1P01562 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA1P01562 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA1P01562 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA1P01562 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA1P01562 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA1P01562 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA1P01562 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNA1P01562 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFNA1P01562 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA1P01562 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA1P01562 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNA1P01562 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNA1P01562 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNA1P01562 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNA1P01562 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNA1P01562 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA1P01562 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA1P01562 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA1P01562 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA1P01562 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA1P01562 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNA1P01562 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA1P01562 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNA1P01562 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA1P01562 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA1P01562 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA1P01562 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA1P01562 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA1P01562 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNA1P01562 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA1P01562 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA1P01562 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA1P01562 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA1P01562 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA1P01562 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA1P01562 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA1P01562 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA1P01562 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA1P01562 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA1P01562 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA1P01562 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA1P01562 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNA1P01562 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNA1P01562 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNA1P01562 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNA1P01562 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA1P01562 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA1P01562 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNA1P01562 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA1P01562 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA1P01562 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA1P01562 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA1P01562 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA1P01562 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNA1P01562 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA1P01562 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNA1P01562 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNA1P01562 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNA1P01562 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA1P01562 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNA1P01562 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms