Protein–RNA interactions for Protein: O95858

TSPAN15, Tetraspanin-15, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN15O95858 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSPAN15O95858 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN15O95858 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN15O95858 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN15O95858 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN15O95858 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN15O95858 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN15O95858 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN15O95858 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN15O95858 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN15O95858 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN15O95858 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN15O95858 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN15O95858 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN15O95858 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN15O95858 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN15O95858 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN15O95858 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN15O95858 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN15O95858 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN15O95858 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN15O95858 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN15O95858 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN15O95858 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN15O95858 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN15O95858 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN15O95858 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN15O95858 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN15O95858 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN15O95858 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN15O95858 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN15O95858 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN15O95858 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN15O95858 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN15O95858 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN15O95858 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN15O95858 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN15O95858 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN15O95858 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN15O95858 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN15O95858 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN15O95858 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN15O95858 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN15O95858 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN15O95858 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN15O95858 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN15O95858 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN15O95858 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN15O95858 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN15O95858 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN15O95858 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN15O95858 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN15O95858 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN15O95858 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN15O95858 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN15O95858 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN15O95858 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN15O95858 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN15O95858 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN15O95858 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN15O95858 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN15O95858 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN15O95858 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN15O95858 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN15O95858 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN15O95858 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN15O95858 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN15O95858 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN15O95858 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN15O95858 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN15O95858 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN15O95858 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN15O95858 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN15O95858 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN15O95858 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN15O95858 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN15O95858 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN15O95858 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN15O95858 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN15O95858 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN15O95858 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN15O95858 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN15O95858 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN15O95858 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN15O95858 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN15O95858 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN15O95858 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN15O95858 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN15O95858 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN15O95858 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN15O95858 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN15O95858 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN15O95858 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN15O95858 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN15O95858 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN15O95858 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN15O95858 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN15O95858 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN15O95858 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN15O95858 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms