Protein–RNA interactions for Protein: O43555

GNRH2, Progonadoliberin-2, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNRH2O43555 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GNRH2O43555 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNRH2O43555 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNRH2O43555 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GNRH2O43555 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNRH2O43555 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNRH2O43555 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNRH2O43555 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GNRH2O43555 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNRH2O43555 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNRH2O43555 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNRH2O43555 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNRH2O43555 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNRH2O43555 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNRH2O43555 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNRH2O43555 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNRH2O43555 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNRH2O43555 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNRH2O43555 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNRH2O43555 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GNRH2O43555 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNRH2O43555 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNRH2O43555 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNRH2O43555 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNRH2O43555 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNRH2O43555 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNRH2O43555 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNRH2O43555 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNRH2O43555 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNRH2O43555 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNRH2O43555 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNRH2O43555 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNRH2O43555 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNRH2O43555 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNRH2O43555 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNRH2O43555 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNRH2O43555 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNRH2O43555 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNRH2O43555 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNRH2O43555 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNRH2O43555 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNRH2O43555 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNRH2O43555 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNRH2O43555 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNRH2O43555 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNRH2O43555 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNRH2O43555 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNRH2O43555 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNRH2O43555 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNRH2O43555 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNRH2O43555 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNRH2O43555 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNRH2O43555 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNRH2O43555 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNRH2O43555 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNRH2O43555 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNRH2O43555 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNRH2O43555 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNRH2O43555 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNRH2O43555 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNRH2O43555 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNRH2O43555 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNRH2O43555 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNRH2O43555 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNRH2O43555 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GNRH2O43555 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNRH2O43555 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GNRH2O43555 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNRH2O43555 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNRH2O43555 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNRH2O43555 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNRH2O43555 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNRH2O43555 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNRH2O43555 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNRH2O43555 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNRH2O43555 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNRH2O43555 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNRH2O43555 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNRH2O43555 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNRH2O43555 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNRH2O43555 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNRH2O43555 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GNRH2O43555 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNRH2O43555 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNRH2O43555 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNRH2O43555 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNRH2O43555 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNRH2O43555 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GNRH2O43555 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNRH2O43555 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNRH2O43555 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNRH2O43555 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms