Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TULP2O00295 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TULP2O00295 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TULP2O00295 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TULP2O00295 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TULP2O00295 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TULP2O00295 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TULP2O00295 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TULP2O00295 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TULP2O00295 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP2O00295 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TULP2O00295 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TULP2O00295 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TULP2O00295 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TULP2O00295 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TULP2O00295 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TULP2O00295 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TULP2O00295 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TULP2O00295 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP2O00295 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TULP2O00295 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TULP2O00295 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TULP2O00295 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP2O00295 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP2O00295 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TULP2O00295 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TULP2O00295 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TULP2O00295 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TULP2O00295 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TULP2O00295 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TULP2O00295 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TULP2O00295 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TULP2O00295 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TULP2O00295 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TULP2O00295 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TULP2O00295 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TULP2O00295 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TULP2O00295 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TULP2O00295 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TULP2O00295 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TULP2O00295 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TULP2O00295 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP2O00295 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TULP2O00295 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP2O00295 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP2O00295 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TULP2O00295 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TULP2O00295 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TULP2O00295 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TULP2O00295 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TULP2O00295 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TULP2O00295 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP2O00295 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP2O00295 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP2O00295 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TULP2O00295 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP2O00295 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP2O00295 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TULP2O00295 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TULP2O00295 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TULP2O00295 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TULP2O00295 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TULP2O00295 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TULP2O00295 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TULP2O00295 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TULP2O00295 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TULP2O00295 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TULP2O00295 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TULP2O00295 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TULP2O00295 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TULP2O00295 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TULP2O00295 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TULP2O00295 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TULP2O00295 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TULP2O00295 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TULP2O00295 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TULP2O00295 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TULP2O00295 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TULP2O00295 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TULP2O00295 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TULP2O00295 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TULP2O00295 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TULP2O00295 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TULP2O00295 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TULP2O00295 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TULP2O00295 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TULP2O00295 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TULP2O00295 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TULP2O00295 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TULP2O00295 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TULP2O00295 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TULP2O00295 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TULP2O00295 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TULP2O00295 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TULP2O00295 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TULP2O00295 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TULP2O00295 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TULP2O00295 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TULP2O00295 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TULP2O00295 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms