Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POC1B-GALNT4F8VUJ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms