Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRN3E7EW58 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRN3E7EW58 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRN3E7EW58 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRN3E7EW58 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRN3E7EW58 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRN3E7EW58 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRN3E7EW58 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRN3E7EW58 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRN3E7EW58 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRN3E7EW58 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRN3E7EW58 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRN3E7EW58 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRN3E7EW58 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRN3E7EW58 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRN3E7EW58 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRN3E7EW58 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRN3E7EW58 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRN3E7EW58 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRN3E7EW58 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRN3E7EW58 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRN3E7EW58 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRN3E7EW58 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRN3E7EW58 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRN3E7EW58 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRN3E7EW58 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRN3E7EW58 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRN3E7EW58 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRN3E7EW58 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRN3E7EW58 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRN3E7EW58 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRN3E7EW58 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRN3E7EW58 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRN3E7EW58 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRN3E7EW58 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRN3E7EW58 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRN3E7EW58 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRN3E7EW58 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRN3E7EW58 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRN3E7EW58 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRN3E7EW58 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRN3E7EW58 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRN3E7EW58 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRN3E7EW58 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRN3E7EW58 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRN3E7EW58 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRN3E7EW58 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRN3E7EW58 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRN3E7EW58 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRN3E7EW58 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRN3E7EW58 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRN3E7EW58 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRN3E7EW58 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRN3E7EW58 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRN3E7EW58 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRN3E7EW58 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRN3E7EW58 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRN3E7EW58 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRN3E7EW58 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRN3E7EW58 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRN3E7EW58 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRN3E7EW58 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRN3E7EW58 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRN3E7EW58 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRN3E7EW58 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRN3E7EW58 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN3E7EW58 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN3E7EW58 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRN3E7EW58 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRN3E7EW58 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRN3E7EW58 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRN3E7EW58 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRN3E7EW58 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRN3E7EW58 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRN3E7EW58 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRN3E7EW58 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRN3E7EW58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRN3E7EW58 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRN3E7EW58 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRN3E7EW58 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN3E7EW58 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN3E7EW58 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRN3E7EW58 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRN3E7EW58 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRN3E7EW58 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRN3E7EW58 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRN3E7EW58 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRN3E7EW58 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRN3E7EW58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRN3E7EW58 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRN3E7EW58 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRN3E7EW58 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRN3E7EW58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRN3E7EW58 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRN3E7EW58 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRN3E7EW58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRN3E7EW58 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRN3E7EW58 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRN3E7EW58 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRN3E7EW58 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms