Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZ34

SHISA8, Putative protein shisa-8, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA8B8ZZ34 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHISA8B8ZZ34 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHISA8B8ZZ34 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SHISA8B8ZZ34 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHISA8B8ZZ34 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHISA8B8ZZ34 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHISA8B8ZZ34 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHISA8B8ZZ34 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHISA8B8ZZ34 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHISA8B8ZZ34 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHISA8B8ZZ34 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHISA8B8ZZ34 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA8B8ZZ34 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHISA8B8ZZ34 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHISA8B8ZZ34 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHISA8B8ZZ34 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA8B8ZZ34 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHISA8B8ZZ34 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHISA8B8ZZ34 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHISA8B8ZZ34 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHISA8B8ZZ34 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHISA8B8ZZ34 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHISA8B8ZZ34 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHISA8B8ZZ34 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHISA8B8ZZ34 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA8B8ZZ34 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA8B8ZZ34 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SHISA8B8ZZ34 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA8B8ZZ34 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHISA8B8ZZ34 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA8B8ZZ34 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA8B8ZZ34 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA8B8ZZ34 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA8B8ZZ34 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA8B8ZZ34 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA8B8ZZ34 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA8B8ZZ34 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA8B8ZZ34 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHISA8B8ZZ34 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHISA8B8ZZ34 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA8B8ZZ34 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHISA8B8ZZ34 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA8B8ZZ34 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHISA8B8ZZ34 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SHISA8B8ZZ34 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHISA8B8ZZ34 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHISA8B8ZZ34 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA8B8ZZ34 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHISA8B8ZZ34 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHISA8B8ZZ34 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHISA8B8ZZ34 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHISA8B8ZZ34 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SHISA8B8ZZ34 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA8B8ZZ34 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHISA8B8ZZ34 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA8B8ZZ34 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHISA8B8ZZ34 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHISA8B8ZZ34 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHISA8B8ZZ34 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA8B8ZZ34 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHISA8B8ZZ34 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHISA8B8ZZ34 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA8B8ZZ34 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHISA8B8ZZ34 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHISA8B8ZZ34 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHISA8B8ZZ34 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA8B8ZZ34 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHISA8B8ZZ34 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHISA8B8ZZ34 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHISA8B8ZZ34 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA8B8ZZ34 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHISA8B8ZZ34 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA8B8ZZ34 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA8B8ZZ34 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA8B8ZZ34 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHISA8B8ZZ34 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA8B8ZZ34 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA8B8ZZ34 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA8B8ZZ34 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA8B8ZZ34 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA8B8ZZ34 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA8B8ZZ34 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA8B8ZZ34 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHISA8B8ZZ34 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA8B8ZZ34 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA8B8ZZ34 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA8B8ZZ34 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA8B8ZZ34 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA8B8ZZ34 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHISA8B8ZZ34 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHISA8B8ZZ34 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHISA8B8ZZ34 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA8B8ZZ34 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHISA8B8ZZ34 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHISA8B8ZZ34 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA8B8ZZ34 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA8B8ZZ34 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA8B8ZZ34 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA8B8ZZ34 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA8B8ZZ34 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms