Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRBV5-5A0A0J9YX44 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRBV5-5A0A0J9YX44 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRBV5-5A0A0J9YX44 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRBV5-5A0A0J9YX44 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRBV5-5A0A0J9YX44 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRBV5-5A0A0J9YX44 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRBV5-5A0A0J9YX44 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRBV5-5A0A0J9YX44 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRBV5-5A0A0J9YX44 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRBV5-5A0A0J9YX44 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRBV5-5A0A0J9YX44 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRBV5-5A0A0J9YX44 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRBV5-5A0A0J9YX44 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRBV5-5A0A0J9YX44 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRBV5-5A0A0J9YX44 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRBV5-5A0A0J9YX44 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRBV5-5A0A0J9YX44 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRBV5-5A0A0J9YX44 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRBV5-5A0A0J9YX44 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRBV5-5A0A0J9YX44 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRBV5-5A0A0J9YX44 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRBV5-5A0A0J9YX44 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRBV5-5A0A0J9YX44 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRBV5-5A0A0J9YX44 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRBV5-5A0A0J9YX44 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRBV5-5A0A0J9YX44 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRBV5-5A0A0J9YX44 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBV5-5A0A0J9YX44 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBV5-5A0A0J9YX44 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV5-5A0A0J9YX44 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV5-5A0A0J9YX44 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV5-5A0A0J9YX44 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-5A0A0J9YX44 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-5A0A0J9YX44 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV5-5A0A0J9YX44 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBV5-5A0A0J9YX44 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-5A0A0J9YX44 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBV5-5A0A0J9YX44 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBV5-5A0A0J9YX44 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBV5-5A0A0J9YX44 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRBV5-5A0A0J9YX44 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRBV5-5A0A0J9YX44 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRBV5-5A0A0J9YX44 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRBV5-5A0A0J9YX44 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBV5-5A0A0J9YX44 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBV5-5A0A0J9YX44 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRBV5-5A0A0J9YX44 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRBV5-5A0A0J9YX44 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV5-5A0A0J9YX44 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV5-5A0A0J9YX44 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV5-5A0A0J9YX44 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV5-5A0A0J9YX44 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV5-5A0A0J9YX44 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBV5-5A0A0J9YX44 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRBV5-5A0A0J9YX44 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRBV5-5A0A0J9YX44 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBV5-5A0A0J9YX44 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBV5-5A0A0J9YX44 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBV5-5A0A0J9YX44 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBV5-5A0A0J9YX44 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBV5-5A0A0J9YX44 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBV5-5A0A0J9YX44 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBV5-5A0A0J9YX44 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBV5-5A0A0J9YX44 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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