Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGKV1-27A0A075B6S5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGKV1-27A0A075B6S5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV1-27A0A075B6S5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGKV1-27A0A075B6S5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGKV1-27A0A075B6S5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGKV1-27A0A075B6S5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGKV1-27A0A075B6S5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGKV1-27A0A075B6S5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGKV1-27A0A075B6S5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGKV1-27A0A075B6S5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGKV1-27A0A075B6S5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV1-27A0A075B6S5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGKV1-27A0A075B6S5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGKV1-27A0A075B6S5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGKV1-27A0A075B6S5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGKV1-27A0A075B6S5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGKV1-27A0A075B6S5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGKV1-27A0A075B6S5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGKV1-27A0A075B6S5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGKV1-27A0A075B6S5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGKV1-27A0A075B6S5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGKV1-27A0A075B6S5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGKV1-27A0A075B6S5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGKV1-27A0A075B6S5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGKV1-27A0A075B6S5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IGKV1-27A0A075B6S5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGKV1-27A0A075B6S5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGKV1-27A0A075B6S5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGKV1-27A0A075B6S5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGKV1-27A0A075B6S5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGKV1-27A0A075B6S5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGKV1-27A0A075B6S5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGKV1-27A0A075B6S5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGKV1-27A0A075B6S5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGKV1-27A0A075B6S5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGKV1-27A0A075B6S5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGKV1-27A0A075B6S5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGKV1-27A0A075B6S5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGKV1-27A0A075B6S5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGKV1-27A0A075B6S5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGKV1-27A0A075B6S5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGKV1-27A0A075B6S5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGKV1-27A0A075B6S5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGKV1-27A0A075B6S5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGKV1-27A0A075B6S5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGKV1-27A0A075B6S5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGKV1-27A0A075B6S5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGKV1-27A0A075B6S5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGKV1-27A0A075B6S5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGKV1-27A0A075B6S5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGKV1-27A0A075B6S5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGKV1-27A0A075B6S5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGKV1-27A0A075B6S5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGKV1-27A0A075B6S5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGKV1-27A0A075B6S5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGKV1-27A0A075B6S5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGKV1-27A0A075B6S5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGKV1-27A0A075B6S5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGKV1-27A0A075B6S5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGKV1-27A0A075B6S5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGKV1-27A0A075B6S5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGKV1-27A0A075B6S5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGKV1-27A0A075B6S5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IGKV1-27A0A075B6S5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGKV1-27A0A075B6S5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGKV1-27A0A075B6S5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGKV1-27A0A075B6S5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGKV1-27A0A075B6S5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IGKV1-27A0A075B6S5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGKV1-27A0A075B6S5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGKV1-27A0A075B6S5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGKV1-27A0A075B6S5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGKV1-27A0A075B6S5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGKV1-27A0A075B6S5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGKV1-27A0A075B6S5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGKV1-27A0A075B6S5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGKV1-27A0A075B6S5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGKV1-27A0A075B6S5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV1-27A0A075B6S5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms