Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIZ1Q9ULV3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms