Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3EQ9NVU0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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