Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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MS4A6AQ9H2W1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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MS4A6AQ9H2W1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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MS4A6AQ9H2W1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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MS4A6AQ9H2W1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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MS4A6AQ9H2W1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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MS4A6AQ9H2W1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A6AQ9H2W1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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