Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms