Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3AQ99856 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3AQ99856 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3AQ99856 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3AQ99856 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3AQ99856 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARID3AQ99856 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARID3AQ99856 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID3AQ99856 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID3AQ99856 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID3AQ99856 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms