Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms