Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP54Q7Z3B4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms