Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EIPR1Q53HC9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EIPR1Q53HC9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms