Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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