Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms