Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 PCNP-205ENST00000470490 589 ntTSL 513.27□□□□□ -0.293e-6■■■■□ 19.5
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TARDBPQ13148 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.465e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.465e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PCNP-204ENST00000469941 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PCNP-206ENST00000486406 742 ntTSL 28.32□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 19.5
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TARDBPQ13148 PRH1-202ENST00000536086 554 ntTSL 56.03□□□□□ -1.447e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PRR4-202ENST00000534923 533 ntTSL 24.62□□□□□ -1.677e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.323e-7■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 RAPGEF6-209ENST00000510071 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 RAPGEF6-214ENST00000515170 4103 ntTSL 29.5□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.751e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.891e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.597e-7■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 SEMA4B-206ENST00000558895 533 ntTSL 424.32■■□□□ 1.483e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 SEMA4B-218ENST00000561085 582 ntTSL 422.57■■□□□ 1.23e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 422.12■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 19.4
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TARDBPQ13148 SEMA4B-216ENST00000560263 540 ntTSL 415.25■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 59.12□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 PTBP1-215ENST00000589883 683 ntTSL 319.53■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 ZEB2-221ENST00000479735 543 ntTSL 419.77■□□□□ 0.769e-7■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.119e-7■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 19.4
TARDBPQ13148 ZEB2-231ENST00000630572 468 ntTSL 512.84□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 19.4
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TARDBPQ13148 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.829e-7■■■■□ 19.4
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TARDBPQ13148 ZEB2-211ENST00000444559 577 ntTSL 48.26□□□□□ -1.099e-7■■■■□ 19.4
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TARDBPQ13148 ZEB2-216ENST00000465308 1071 ntTSL 58.08□□□□□ -1.129e-7■■■■□ 19.4
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TARDBPQ13148 ANGPT1-202ENST00000517746 4322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best)2.93□□□□□ -1.943e-6■■■■□ 19.3
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TARDBPQ13148 ATL2-213ENST00000474535 597 ntTSL 33.07□□□□□ -1.922e-6■■■■□ 19.3
TARDBPQ13148 PDCD11-206ENST00000493610 732 ntTSL 513.58□□□□□ -0.243e-10■■■■□ 19.3
TARDBPQ13148 PDCD11-203ENST00000471061 410 ntTSL 212.58□□□□□ -0.43e-10■■■■□ 19.3
TARDBPQ13148 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-10■■■■□ 19.3
TARDBPQ13148 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.153e-7■■■■□ 19.3
TARDBPQ13148 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 19.3
TARDBPQ13148 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 19.3
TARDBPQ13148 FADS3-202ENST00000414624 1452 ntTSL 216.68■□□□□ 0.267e-7■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 ARIH2-207ENST00000452385 2778 ntTSL 28.99□□□□□ -0.973e-6■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 ARIH2-229ENST00000495507 112 ntTSL 52.66□□□□□ -1.983e-6■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 ESYT2-204ENST00000483958 546 ntTSL 46.91□□□□□ -1.33e-7■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 RBSN-205ENST00000449964 1132 ntTSL 520.22■□□□□ 0.834e-7■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 RBSN-209ENST00000507357 582 ntTSL 418.82■□□□□ 0.64e-7■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-7■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 RBSN-203ENST00000441057 1352 ntTSL 517.28■□□□□ 0.364e-7■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.34e-7■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.814e-7■■■□□ 19.2
TARDBPQ13148 C8orf44-203ENST00000519561 1835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.625e-9■■■□□ 19.2
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