Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXD4Q12950 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXD4Q12950 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXD4Q12950 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXD4Q12950 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXD4Q12950 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FOXD4Q12950 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FOXD4Q12950 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4Q12950 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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