Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD83Q01151 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD83Q01151 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD83Q01151 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD83Q01151 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms