Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPCAP84074 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPCAP84074 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPCAP84074 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPCAP84074 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPCAP84074 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms