Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HRCP23327 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HRCP23327 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HRCP23327 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HRCP23327 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HRCP23327 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HRCP23327 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
HRCP23327 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HRCP23327 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms