Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms