Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1CO15160 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms