Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNAL1Q9UBT7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms