Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SHANK2-AS3Q9BTD1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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