Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CS-211ENST00000548041 561 ntTSL 47.3□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 CS-206ENST00000546930 568 ntTSL 47.01□□□□□ -1.294e-8■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 CS-216ENST00000549221 553 ntTSL 46.65□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 CS-233ENST00000552688 580 ntTSL 45.93□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 34.1
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PRPF8Q6P2Q9 RPL21-206ENST00000466550 756 ntTSL 210.05□□□□□ -0.81e-13■■■■■ 33.9
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PRPF8Q6P2Q9 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.751e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 LIMK2-206ENST00000462625 1042 ntTSL 219.73■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 CCHCR1-211ENST00000467553 589 ntTSL 312.1□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 33.9
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PRPF8Q6P2Q9 AKR1C3-206ENST00000602997 636 ntTSL 34.06□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A2-212ENST00000552703 528 ntTSL 24.07□□□□□ -1.761e-20■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A2-206ENST00000548785 578 ntTSL 31.82□□□□□ -2.121e-20■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 POLA2-203ENST00000527618 1924 ntTSL 212.12□□□□□ -0.475e-15■■■■■ 33.9
PRPF8Q6P2Q9 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-26■■■■■ 33.9
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