Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM74A1Q5RGS3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms